Repeat motif mining

次世代シーケンスデータを使用して、ゲノム上のリピートモチーフ(※マイクロサテライト、SSR、STR)を検索します。ゲノムサイズの大きな動植物でも、少量のリードデータからリピートモチーフを検索することができます。

※ リピートモチーフについて
リピートモチーフは、ゲノム上に存在する数塩基の繰り返し配列で、多型解析のマーカーとして使用されます。マイクロサテライト(microsatellite)、SSR(simple sequence repeats)、STR(short tandem repeat)とも呼ばれます。

HSS:リピートモチーフ検索

 

解析例

弊社作業内容

DNAライブラリ調製
MiSeq 300bp ペアエンドシーケンス 10万リードペア(60Mb)/ 検体
リピートモチーフ検索

価格

201,000円 / 検体(税別)

 

納品データ

リピートモチーフとその前後の塩基配列情報をまとめたテーブルを納品いたします。
リピートモチーフを挟む領域でPCRプライマーを設計していただくことができます。

HSS:リピートモチーフ検索

サンプル必要量

提供サンプル種別 総量 濃度 液量
DNA 4 ug 以上 40 ng/uL 以上 30 uL 以上
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