- HOME
- Products & Services
- Guide to select the best application for your purpose
- Repeat motif mining
-
Protein Related Service
-
Research Support
-
Laboratory Items
-
Custom DNA/RNA Systhesis
-
Next Generation Sequencing
- Next Generation Sequencing
-
Guide to select the best application for your purpose
- Guide to select the best application for your purpose
- Human genome sequencing
- Genome re-sequencing (other than Human)
- Microbial genome sequencing
- Small scale sequencing (NGS Petit)
- GRAS-Di
- Repeat motif mining
- Gene expression analysis (for organisms with a reference sequence available)
- Iso-Seq analysis
- De novo transcriptome sequencing
- Small RNA-Seq analysis
- Microbial community analysis
- Shotgun metagenome sequencing
- Metatranscriptome sequencing
- ChIP-Seq analysis
- CRISPR screening analysis
- Illumina amplicon sequencing
- PacBio amplicon sequencing
- Standard pipeline analysis
- Custom analysis
- Gene analysis from a pathological specimen (option)
- Sequencer type and sequencing principle
- Required amount of sample
- How to order
- Scientific Publications
-
Custom DNA Sequencing
-
Custom DNA Microarray
Repeat motif mining
次世代シーケンスデータを使用して、ゲノム上のリピートモチーフ(※マイクロサテライト、SSR、STR)を検索します。ゲノムサイズの大きな動植物でも、少量のリードデータからリピートモチーフを検索することができます。
※ リピートモチーフについて
リピートモチーフは、ゲノム上に存在する数塩基の繰り返し配列で、多型解析のマーカーとして使用されます。マイクロサテライト(microsatellite)、SSR(simple sequence repeats)、STR(short tandem repeat)とも呼ばれます。
解析例
弊社作業内容
・ DNAライブラリ調製
・ MiSeq 300bp ペアエンドシーケンス 10万リードペア(60Mb)/ 検体
・ リピートモチーフ検索
価格
201,000円 / 検体(税別)
納品データ
リピートモチーフとその前後の塩基配列情報をまとめたテーブルを納品いたします。
リピートモチーフを挟む領域でPCRプライマーを設計していただくことができます。
サンプル必要量
提供サンプル種別 | 総量 | 濃度 | 液量 |
DNA | 4 ug 以上 | 40 ng/uL 以上 | 30 uL 以上 |