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Small scale sequencing (NGS Petit)
解析概要
ウイルスゲノム、プラスミド、Long-PCR産物等、数kb～200kb程度の範囲のDNA分子を対象に、Illumina MiSeqによるDNA-Seq解析を行います。
約60Mb～のMiSeq乗り合い解析で、短期間で最小限のデータ取得が可能です。
約60Mb～のMiSeq乗り合い解析で、短期間で最小限のデータ取得が可能です。
ご活用例
・ ウイルスゲノムDNAの全長配列の決定
・ プラスミドDNAの全長配列の決定
・ Long-PCR産物の全長配列の決定
＜ このような活用事例もございます ＞
・ 高等生物のゲノムDNAを対象にしたマイクロサテライト領域探索 (低カバレッジ解析)
・ リンカー配列が付いていないPCR産物(200～450bp)のAmplicon-Seq解析 (断片化をスキップ)
解析仕様
| 使用機器 | Illumina MiSeq |
| ライブラリ | PCR-Plus / PCR-Free 選択可能 |
| 読み取り方法 | Paired-End法（300bp x 2） |
| データ取得量 | 60Mb（10万リードペア）※1 |
| データ解析 | お問い合わせください。※2 |
※1 データ取得量は、60Mb単位を1口として変更可能です。ご希望がございましたら事前にお問い合わせください。
※2 データ解析は、アセンブル/マッピング/その他、ご研究の内容・ご要望に応じて適宜対応いたします。
サンプル必要量
| 提供サンプル種別 | 総量 | 濃度 | 液量 |
| DNA | 4 ug 以上 | 40 ng/uL 以上 | 30 uL 以上 |
| 精製済 Long-PCR 産物 | 4 ug 以上 | 40 ng/uL 以上 | 30 uL 以上 |
| 精製済 PCR 産物（～ 800 bp） | ～ 2 ug | ～ 20 ng/uL | 30 uL 以上 |