Custom analysis

解析概要

弊社、あるいは他施設で取得されたRawデータをお預かりして、弊社の標準パイプラインを利用した解析処理を実施いたします。
お手持ちのNGS機器、お近くの機器施設、他受託業者にて取得したデータの受け入れも可能ですので、データ解析でお困りの際はお気軽にお問い合わせください。

解析の流れ

ご相談事例

 コンタミが疑われるサンプル由来のデータの中から、注目する生物に由来するリード情報のみを抽出し、アセンブルを行ってみたい。

 RNA-Seqを行って得たトランスクリプト配列の中から、注目する遺伝子・タンパクの配列を検索したい。

 近縁な2種類のバクテリアゲノム配列を比較して、一方にのみ特徴的な領域を検索し、プライマーを設計したい。

 タンパクのN末端配列解析で得られた断片的なアミノ酸配列を利用して、対応するトランスクリプト配列をRNA-Seq解析データの中から抽出したい。

 お手持ちの解析ソフトやパイプラインにインプット可能な形式になるようデータの編集・変換を行って欲しい。

 過去に解析済みのデータを持っているが、最新のデータベース情報を利用した再解析を行ってみたい。

 過去数回に分けて取得したデータを利用して、検体の組み合わせを変えて再解析を行ってみたい。

 参考にしている論文で使用している解析プログラムを利用して、お手持ちのデータの解析を行ってみたい。

 NGSデータを利用した論文化にあたって、参考文献にあるようなFigを作成したい。

 DRA、DDBJ、GEOへのデータ登録作業を代行して欲しい。

 

上記は、あくまでも一例となりますので、お困りごとがありましたら、まずはお気軽にお問い合わせください。
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