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遺伝子発現マイクロアレイ解析

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製品仕様

特長

  • 高感度・高精度と性能面での評価が高いアジレントマイクロアレイを使用
  • サンプル品質検査からデータ解析まで全工程を自社で完結
  • アジレント社公式認定サービスプロバイダとして信頼のデータを取得
  • ヒト・マウスの小規模実験に対応したお得な乗合プランを提供

 

サービス内容

01　サンプル品質検査 02　マイクロアレイ実験 03　基本解析
NanoDrop、Bioanalyzer、またはTapeStationを使用して検体の品質評価を行います。基本料金には送付2回分まで含まれています。 核酸サンプルの蛍光色素標識から、アレイスライドへのハイブリダイゼーション、Rawデータ取得まで全工程をサポートします。 正規化（ノーマライズ）を行い、検体や群同士の比較による発現変動遺伝子を抽出します。ノーマライズ法や閾値は各実験データに合わせて調整します。

取扱アレイ一覧　

アジレント遺伝子発現マイクロアレイは、解析法として 1カラー法 と 2カラー法 が選択できます。各法の違いについては、FAQ をご参照ください。

 

解析プラン

ヒト（SurePrint G3 Human GE 8x60K Ver.3.0）またはマウス（SurePrint G3 Mouse GE 8x60K Ver. 2.0）の解析を希望されるお客様に、以下の2種類の解析プランをご提供しています。他のアレイについては通常プランのみとなります。

スライド単位で解析を行います。
サンプルの品質検査に合格し、アレイが入荷次第、納期を設定します。
スピーディに解析結果を得たいお客様に最適です。
8解析未満の少数検体の解析を希望するお客様向けのプランです。
スライド上の8アレイを他のお客様とシェアすることで、コストを抑えて解析を行います。
少数のサンプルをお得に解析したいお客様におすすめです。

納品データ

品名 内容 形式 詳細
書面 ・作業報告書 － －
記録メディア
・CD-R
・DVD-R
・USBメモリ		 ・Rawデータ txt アレイシステム（数値化ソフトウェア）から出力されるシグナルデータ
・スライドスキャン画像 tif, bmp スキャナで取得した画像。数値データ（Rawデータ）を得る元になるデータ
・シグナルテーブル xlsx ノーマライズ済みシグナル値、検体比較の発現比（LogFC）、変動遺伝子のリスト、ベースライン補正値
・ビジュアルサマリー html ボックスプロット、スキャッタープロット、相関解析、主成分分析、クラスター解析、サンプル情報
・データ解説資料 pdf Rawデータや解析データの解説資料
・作業プロトコル pdf アレイ実験のプロトコル、実験～データ解析の条件値
・サンプル品質検査結果 pdf サンプル品質検査のレポート
・作業報告書 pdf 書面の作業報告書のpdfデータ
  • ※　弊社のデータ保管期間は納品後6ヶ月です。保管期間を過ぎたデータのお問い合わせや追加解析の際は、データをご提供いただく場合がございますので、データは大切に保管してください。

標準解析データ例　

 

価格・納期

サービス名 納期 価格
アジレント
遺伝子発現
アレイ解析		 乗合プラン　1カラー 下記条件に適応後、3週間（最大3ヶ月）
・サンプル品質検査合格
・乗合サンプル集積		 お問い合わせください
乗合プラン　2カラー
通常プラン　1カラー 下記条件に適応後、3週間
・解析スライド入荷
・サンプル品質検査合格
通常プラン　2カラー
  • ※ サンプル品質検査料金は2回分（再送分）まで価格に含まれています。
  • ※ 乗合プランは SurePrint G3 Human 8x60K v3 または SurePrint G3 Mouse 8x60K v2 での解析のみご利用いただけます。
  • ※ 納期はご注文内容（解析数）によって変動いたします。

 

必要サンプル

サンプルの種類 必要量 純度・状態
Total RNA 総量：500ng以上
濃度：50ng/μL以上
液量：10μL以上		 A260/A280：1.8～2.0
A260/A230：2.0以上
Nuclease Free水に溶解
  • ※ 弊社ではQIAGEN社 RNeasy Mini KitでのRNA抽出、および、RNase-Free DNase SetでのDNase処理を推奨しています。
  • ※ DEPC水は反応を阻害する恐れがあります。RNAは必ずNuclease Free水に溶解してください。

核酸抽出サービス　


マイクロアレイ解析用RNAの品質管理　

 

注文方法

ご注文の流れ

Step 01
お問い合わせ
まずは専用フォームよりお問い合わせください。
Step 02
御見積
注文内容の確認後、御見積をご案内いたします。
Step 03
注文書記入・送付
ご希望の解析法の注文書を記入後、 array@hssnet.co.jp 宛にメール添付にてお送りください。

遺伝子発現１カラー注文書

遺伝子発現２カラー注文書
Step 04
サンプル送付
平日到着にてサンプルをお送りください。
送付方法について詳しくは次項のサンプル送付方法をご確認ください。

サンプル送付方法

 RNAサンプル

チューブが破損しないようチューブBOX等に入れ、印刷した注文書と、ドライアイスを5kg 程度同梱し、冷凍便 または 冷蔵便にて下記宛に送付してください。

 サンプル送付先 
〒001-0932
北海道札幌市北区新川西2条1丁目2-1
北海道システム・サイエンス株式会社　解析チーム
マイクロアレイ解析サービス担当
TEL：(011)768-5901
  • ※　サンプルを送付していただく際は、①到着予定日、②輸送会社名、③追跡番号をE-mailにてお知らせください。
  • ※　誠に勝手ながら、土・日・祝日の受け取りは行っていませんので、平日着となるよう送付してください。
  • ※　納品後のサンプルについては、3ヶ月保管したのち廃棄いたします。サンプルの返却をご希望の場合には、必ず注文書にご記入ください。
  • ※　データ納品時以外のサンプル返却は有償となりますので、あらかじめご了承ください。

 

注意事項

  • 製品の規格仕様・サービス内容は予告なしに変更することがあります。
  • 受注後のキャンセルはサービスの仕様上お受けできません。やむを得ない場合は実作業分の料金をご請求します。
  • ご依頼いただくサンプルはP1レベルに限ります。
  • 感染性のあるサンプルの受け入れは行っていません。ヒト臨床サンプルはインフォームドコンセントを得ていることを確認してください。
  • 本サービスは試験研究を目的にご利用ください。その他の目的（医療品・食品の製造・品質管理や医療診断など）には使用しないでください。
  • 本サービスの結果によって発生した損失や損害について、責任を負いかねます。
  • ご提供いただいたサンプルや指示された手法に関連する工業所有権・安全性に関する問題について、責任を負いかねます。

 

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