お問い合わせ ご注文 EN

一本鎖・微量・損傷 DNA対応ライブラリ調製

ご注文 お問い合わせ
New!!　2024/04
解析が困難だった一本鎖・微量・損傷DNA向けライブラリ調製サービス開始

解析概要

従来法のDNA-Seq解析では、DNAリガーゼを使用し二本鎖DNAを対象にアダプターをライゲーションさせているため、ssDNAウイルスのような一本鎖DNAや、古代DNAのようなニックを多く含む過度に分解・損傷の進んでしまったDNAサンプルのライブラリ調製は非常に困難でした。
本サービスは、一本鎖DNAに対応した専用のライブラリ調製キットを使用することで、これまで解析が難しかった一本鎖・損傷DNAサンプルも対象としたライブラリ調製を行います。
pgオーダーの微量DNAにも対応しており、これまでDNAの収量・分解等の要因により品質検査を通過できなかったサンプルの解析にもお勧めです。

ご活用例

  • ssDNAウイルス等のゲノム解析
  • FFPE試料由来の損傷DNAの配列解析
  • 古代DNAサンプルの配列決定
  • cfDNA等の微量DNAの配列解析
  • 分解・損傷の進んだDNAサンプルの配列決定

サンプル必要量

総量 濃度 液量 備考
1ng 以上 50 pg/µL 以上※1 20 µL 以上 サイズ40 bp以上※2
※1 サンプル受入れ時の品質検定は実施いたしますが、濃度10ng/µL未満の場合、正確な濃度・分解の有無について事前の判定ができません。
上記、濃度は社内テストで確認済みの濃度目安となりますので、あらかじめご了承ください。
※2 サイズが40bp未満の低分子DNAについては、精製過程で除去されてしまうため、解析できません。

注意事項

本サービスで使用するキットでは、Read2の読み初めに配列・塩基長がランダムな Gリッチ配列の付加がございます。
Read2読み初めの付加配列はデータ解析を実施する際にトリミングが必要となるため、有効なリード長が短くなります。

※ 付加される配列の長さは、6～8bp付近をピークとして約25bp付近のサイズ範囲で現れます。

 

関連サービス

本サービスは Illumina DNA-Seq のオプションとしてご利用いただけます。
Illumia シーケンサー ( NovaSeq / NextSeq / MiSeq ) に対応した各種アプリケーションと組み合わせてご依頼ください。

〇 ゲノムリシーケンス解析

〇 微生物ゲノム配列決定

〇 小スケール解析（NGS petit）

〇 ショットガンメタゲノム解析

〇 ChIP-Seq解析

サービス一覧へ戻る
Page Top