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リピートモチーフ検索
解析概要
次世代シーケンスデータを使用して、ゲノム上のリピートモチーフ（※マイクロサテライト、SSR、STR）を検索します。ゲノムサイズの大きな動植物でも、少量のリードデータからリピートモチーフを検索することができます。
※ リピートモチーフについて
リピートモチーフは、ゲノム上に存在する数塩基の繰り返し配列で、多型解析のマーカーとして使用されます。マイクロサテライト（microsatellite）、SSR（simple sequence repeats）、STR（short tandem repeat）とも呼ばれます。
解析例
弊社作業内容
- DNAライブラリ調製
- MiSeq 300bp ペアエンドシーケンス 10万リードペア（60Mb）/ 検体
- リピートモチーフ検索
価格
201,000円 / 検体（税別）
納品データ
リピートモチーフとその前後の塩基配列情報をまとめたテーブルを納品いたします。
リピートモチーフを挟む領域でPCRプライマーを設計していただくことができます。
サンプル必要量
| 提供サンプル種別 | 総量 | 濃度 | 液量 |
| DNA | 4 ug 以上 | 40 ng/uL 以上 | 30 uL 以上 |
