Small RNA-Seq解析

解析概要

Small RNA-Seqデータを使用して、miRNAなどのsmall RNAの発現を解析します。

解析の流れ

解析仕様

使用機器 Illumina NovaSeq
データ量 1,000万リードペア/検体

解析メニュー

【リファレンスゲノムマッピング・既知miRNAの発現解析】
small RNA-Seqのリードをリファレンスゲノムにマッピングし、既知miRNAの発現頻度を算出します。
標準解析では、検体間・群間のFold Change算出まで実施します。

【miRbase相同性検索・推定miRNAの発現解析】
small RNA-Seqのリードの同一配列を集計し、既知miRNAとの相同配列検索を行います。
得られた推定miRNAについて、リードカウント情報を基に発現頻度を予想し、検体間・群間比較を行いFold Changeを算出します。

【有意差検定】
群間におけるmiRNA発現変動の有意差検定を行います。(n≧3 推奨)

サンプル必要量

提供サンプル種別 総量 濃度 液量
total RNA 2 ug 以上 50 ng/uL 以上 30 uL 以上
Small RNA 60 ng 以上 2 ng/uL 以上 30 uL 以上
サービス一覧へ戻る
Page Top