小スケール解析(NGS Petit)

解析概要

ウイルスゲノム、プラスミド、Long-PCR産物等、数kb~200kb程度の範囲のDNA分子を対象に、Illumina MiSeqによるDNA-Seq解析を行います。
約60Mb~のMiSeq乗り合い解析で、短期間で最小限のデータ取得が可能です。

ご活用例

  • ウイルスゲノムDNAの全長配列の決定
  • プラスミドDNAの全長配列の決定
  • Long-PCR産物の全長配列の決定

< このような活用事例もございます >

  • 高等生物のゲノムDNAを対象にしたマイクロサテライト領域探索 (低カバレッジ解析)
  • リンカー配列が付いていないPCR産物(200~450bp)のAmplicon-Seq解析 (断片化をスキップ)

解析仕様

 使用機器  Illumina MiSeq
 ライブラリ  PCR-Plus / PCR-Free 選択可能
 読み取り方法  Paired-End法(300bp x 2)
 データ取得量  60Mb(10万リードペア)※1
 データ解析  お問い合わせください。※2
  • ※1 データ取得量は、60Mb単位を1口として変更可能です。ご希望がございましたら事前にお問い合わせください。
  • ※2 データ解析は、アセンブル/マッピング/その他、ご研究の内容・ご要望に応じて適宜対応いたします。

サンプル必要量

提供サンプル種別 総量 濃度 液量
DNA 4 ug 以上 40 ng/uL 以上 30 uL 以上
精製済 Long-PCR 産物 4 ug 以上 40 ng/uL 以上 30 uL 以上
精製済 PCR 産物(~ 800 bp) ~ 2 ug ~ 20 ng/uL 30 uL 以上
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