Standard pipeline analysis

Inquiry

弊社、あるいは他施設で取得されたRawデータをお預かりして、弊社の標準パイプラインを利用した解析処理を実施いたします。
お手持ちのNGS機器、お近くの機器施設、他受託業者にて取得したデータの受け入れも可能ですので、データ解析でお困りの際はお気軽にお問い合わせください。

標準パイプラインによる解析内容の詳細は、各アプリケーション別ページにてご確認いただけます。

〇ゲノムリシーケンス解析
マッピング・SNP候補検索 / 構造変異検索

〇微生物ゲノム配列決定
De novo アセンブル / 遺伝子領域予測・アノテーション / 薬剤耐性遺伝子検索

〇遺伝子発現解析
発現頻度解析 / 有意差検定 / GO解析 / パスウェイ解析

〇 De novo トランスクリプトーム解析
De novo アセンブル / アノテーション情報付与 / 発現頻度解析 / 指定配列の検索

〇 Small RNA-Seq 解析
マッピング / miRNA の発現頻度解析

〇微生物群集解析
菌叢構成情報の算出 / α多様性情報の算出 / PCoAプロット作成 / 有意差検定(PERMANOVA) / 有意差検定(Differential Abundance Analysis) / 複数データセットの統合

〇 ChIP-Seq 解析
マッピング・ピーク検出 / 検体間のピーク領域比較 / モチーフ検索

〇 CRISPR スクリーニング解析
gRNAリードカウント / gRNAカウントの検体間比較

〇アンプリコンシーケンス解析
リードカウント解析 / 検体間比較テーブル作成 / ターゲット解析

上記、メニューにない解析処理につきましても、柔軟に対応しています。
カスタム解析にて、お気軽にお問い合わせください。

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