Tm値の計算方法

• Tm値の計算

Tm値の計算

Tm値の計算式には代表的なものがいくつかあり、用いる計算式によって値が変化します。
弊社では、「Current Protocols in Molecular Biology」に準拠した計算式を用いています。

● 17mer以下の場合*
4×（G+C+R/2+Y/2+M/2+S+K/2+D/3+H/3+2B/3+2V/3+N/2）＋
2×（A+T+R/2+Y/2+M/2+W+K/2+2D/3+2H/3+B/3+V/3+N/2+I+U）

● 18mer以上の場合*
60.8＋41×{（G+C+R/2+Y/2+M/2+S+K/2+D/3+H/3+2B/3+2V/3+N/2）/塩基数}－（500/塩基数）

* 塩濃度条件
0.0567（M）＝0.05（KCｌ濃度）＋0.01×0.67（Tris濃度）
50mM KCl濃度
10mM Tris-HCl濃度(pH8.4～9.0 at 25℃)