アジレント遺伝子発現アレイ解析

製品仕様

特長

  • サンプルの品質検査~データ解析まで、全作業を自社にて実施します。
  • 純正機器・オゾンフリー環境を完備しており、高品質なデータを取得します。
  • ヒト・マウスの小規模実験に便利な乗合プランをご提供しています。

 

サービス内容

NanoDrop、Bioanalyzer(またはTapeStation)を使用して検体の品質評価を行い、最良の結果が得られるようサポートいたします。送付2回分まで基本料金内に含まれています。
核酸サンプルの蛍光色素標識から、アレイスライドへのハイブリダイゼーション、Rawデータ取得までアレイ実験の全体をお任せください。
正規化(ノーマライズ)を行い、検体や群同士の比較による発現変動遺伝子を抽出します。解析でのノーマライズ法や閾値は、それぞれの実験データに合わせて調整いたします。
アジレントアレイの詳細についてはアジレント社のWebページをご参考ください。
アジレントアレイ製品ページ
搭載遺伝子リストDLページ

 

解析プラン

ヒト(SurePrint G3 Human GE 8x60K Ver.3.0)または マウス(SurePrint G3 Mouse GE 8x60K Ver. 2.0)の解析では、解析プランを下記の2種類から選択できます。

スライド単位で解析致します。サンプル品質検査通過・アレイ入荷の条件が揃い次第納期設定いたしますので、解析結果を早くお届けすることができます。受注製造アレイの場合はスライドの製造に期間がかかりますので、お早めにご相談ください。
8解析未満で解析をご希望の場合に、スライド上の8アレイを他のお客様とシェアして解析するため、少数検体でもお得に解析することができます。規定数の検体が集まるまで解析をお待ちいただく形になります。

納品データ

品名 内容 形式 詳細
書面
・作業報告書
記録メディア
・CD-R
・DVD-R
・USBメモリ
・アレイRawデータ
txt アレイシステム(数値化ソフトウェア)から出力されるシグナルデータ
・アレイスキャン画像
tif, bmp スキャナで取得した画像。数値データ(Rawデータ)を得る元になるデータ
・シグナルテーブル
xlsx ノーマライズ済みシグナル値、検体比較の発現比(LogFC)、変動遺伝子のリスト、ベースライン補正値
・ビジュアルサマリー
html ボックスプロット、スキャッタープロット、相関解析、主成分分析、クラスター解析、サンプル情報 プロット見本
・データ解説資料
pdf Rawデータや解析済みデータの解説資料
・作業プロトコル
pdf アレイ実験のプロトコル、実験~データ解析の条件値
・サンプル品質検査結果
pdf サンプル品質検査のレポート
・作業報告書
pdf 書面の作業報告書のpdfデータ
  • ※ 弊社のデータ保管期間は納品後6ヶ月です。保管期間を過ぎたデータのお問い合わせや追加解析の際は、データをご提供いただく場合がございますので、データは大切に保管してください。

 

価格・納期

サービス名 価格 納期※3
アジレント
遺伝子発現
アレイ解析※1
1カラー(乗合プラン)※2 お問い合わせ
ください
下記条件に適応後、3週間(最大3ヶ月)
・サンプル品質検査合格
・乗合サンプル集積
2カラー(乗合プラン)※2
1カラー(通常プラン) 下記条件に適応後、3週間
・解析スライド入荷
・サンプル品質検査合格
2カラー(通常プラン)
スキャン・数値化 約1週間
スキャン・
数値化
オプション
ノーマライズ 約1週間
データ加工
(解析用データ作成)
※ノーマライズ料金を含む
  • ※1 サンプル品質検査料金は2回分(再送分)まで価格に含まれています。
  • ※2 乗合プランは SurePrint G3 Human 8x60K v3 または SurePrint G3 Mouse 8x60K v2 での解析の場合のみご利用いただけます。
  • ※3 納期はご注文内容(解析数)によって変動いたします。

 

注文方法

ご注文の流れ

Step 01
お問い合わせ
まずは専用フォームよりお問い合わせください。
Step 02
御見積
注文内容の確認後、御見積をご案内いたします。
Step 03
注文書記入・送付
ご希望の解析法の注文書を記入後、 array@hssnet.co.jp 宛にメール添付にてお送りください。

Step 04
サンプル送付
平日到着にてサンプルをお送りください。
送付方法について詳しくはサンプル送付方法をご確認ください。

必要サンプル

サンプルの種類 必要量 純度・状態
Total RNA※1 総量:500ng以上※2
濃度:50ng/μL以上
液量:10μL以上
OD260/OD280:1.8~2.1※3
OD260/OD230:2.0以上※3
Nuclease Free水に溶解※4
RNA抽出からのご依頼はこちらをご覧ください。
  • ※1 弊社ではQIAGEN社 RNeasy Mini KitでのRNA抽出、および、RNase-Free DNase SetでのDNase処理を推奨しています。
  • ※2 アレイ解析に必要なサンプル量はスライドフォーマットによって異なります。
  • ※3 スピンカラムタイプの抽出方法、もしくは低濃度の場合、OD比は無視できる場合があります。
  • ※4 DEPC水は反応を阻害する恐れがあります。RNAは必ずNuclease Free水に溶解してください。
サンプル品質条件についての詳細は、下記リンクの資料をご覧ください。 遺伝子発現解析用サンプルの
品質検査について

 

サンプル送付方法

 RNAサンプル(遺伝子発現アレイ解析サービス)

チューブが破損しないよう 50mL チューブやチューブBOX に入れ、印刷した注文書と、ドライアイスを5kg 程度同梱し、冷凍便 または 冷蔵便にて下記宛に送付してください。

 スライドガラス(スキャン・数値化サービス)

スライドケースに入れ、アルミホイルなどで遮光の上、破損しないよう緩衝材等で保護し、印刷した注文書を同梱して 普通便(常温)にて下記宛に送付してください。

 サンプル送付先 
〒001-0932
北海道札幌市北区新川西2条1丁目2-1
北海道システム・サイエンス株式会社 解析チーム
マイクロアレイ解析サービス担当
TEL:(011)768-5903
  • ※ サンプルやスライドガラスを送付していただく際は、①到着予定日、②輸送会社名、③追跡番号をE-mailにてお知らせください。
  • ※ 誠に勝手ながら、土・日・祝日の受け取りは行っていませんので、平日着となるよう送付してください。
  • ※ 納品後のサンプルについては、RNAサンプルは3ヶ月、スライドガラスは1週間保管したのち、廃棄いたします。サンプルの返却をご希望の場合には、必ず注文書にご記入ください。
  • ※ データ納品時以外のサンプル返却は有償となりますので、あらかじめご了承ください。

 

注意事項

  • 製品の規格仕様・サービス内容などにつきまして、予告なしに変更することがあります。
  • 受注後、実作業に入ってからのキャンセルはサービスの仕様上お受けいたしかねます。やむを得ない場合は実作業分の料金をご請求させていただきます。
  • ご依頼いただくサンプルは、文部科学省の「遺伝子組換え生物等の使用等の規制による生物の多様性の確保に関する法律」(カルタヘナ法)におけるP1レベルのサンプルに限らせていただきます。
  • 感染性のあるサンプル(HCV・HIVなど)の受け入れは弊社では行っていません。また、ヒト臨床サンプルの場合はインフォームドコンセントを得ていることをご確認ください。
  • 本受託解析サービスは、試験研究を目的にご利用ください。その他の目的(医療品・食品の製造・品質管理や医療診断など)には使用しないでください。
  • 本受託解析サービスにより得られた結果が原因となり生じた損失・損害等について、サービスの仕様上、責任を負いかねます。
  • ご提供・ご指示いただくサンプルや手法から生じる工業所有権・安全性などの問題については、一切責任を負いかねます。

 

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