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アジレント遺伝子発現アレイ解析

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アジレントの遺伝子発現アレイは、プロトコルの最適化により、微量なTotal RNA から実験をスタートすることができます。
多様な生物種に対応しており、研究対象の生物種のデザインが無い場合でも配列情報からカスタムアレイとして設計することが可能です。
また、Human・Mouse のデザインには Coding RNAの他、lncRNA も搭載しており、同時に検出することができます。

製品仕様

製品特徴・規格

  • Total RNA 量が最小10ng（※ 8x フォーマットの場合）で解析可能です。
  • Human、Mouse アレイにはIncRNA のプローブも搭載されています。
  • 対象生物種のアレイが無い場合でも、カスタムアレイを設計し、解析することができます。
  • オプションでアレイデザイン、RNA 抽出、データマイニングの各種サービスもご利用いただけます。

  • ※ e-Arrayにご登録いただくと、プローブ塩基配列情報を入手することが可能です。
    入手方法についてはお問い合わせください。

アジレントアレイの詳細についてはアジレント社へお問い合わせください。
(外部サイトにリンクします)

各種製品情報はこちら
搭載遺伝子リストはこちら

解析の流れ

サービス内容

RNA抽出/精製 ※オプション

オプションで組織・細胞からのRNAの抽出/精製も承っております。
弊社ではQIAGEN社 RNeasy Mini Kitを使用しております。
アレイ解析と併せてご注文のお客様には特別価格にてご提供いたします。

 

サンプル品質検査

解析前にNanoDrop(Thermo Fisher Scientific)およびバイオアナライザ(Agilent Technologies)を使用し、サンプルの品質検査を行います。全てのお客様に検査結果をご報告いたします。

  • ・弊社推奨基準以上の場合
  • →お客様のご承認をいただいたのち、アレイ解析を開始します。
  • ・弊社推奨基準以下の場合
  • →今後の作業方針（サンプル再送付、または精製サービスのご利用など）をご相談させていただきます。
  • ※ 品質検査は解析するサンプル数の2倍の数まで無償対応いたします。
    2倍数を超えた場合、別途料金がかかります。予めご了承ください。

 

アレイ解析

ご研究目的に合わせて解析プラン(通常 または 乗合)、解析方法(1カラー または 2カラー)をご選択ください。

各プランのご説明

● 通常プラン
スライド単位でお買上いただいての解析となります。
サンプル品質検査通過、および、アレイ入荷後、すぐに納期を設定いたします。
受注製造アレイの場合、サンプル送付よりも前に注文書を送付していただけますと、アレイスライドを先に発注しておけるため、解析がスムーズに進みます。
ただし、スライド発注後にご注文をキャンセルされる場合は、スライド料金の実費を頂戴いたします。
予めご了承ください。

● 乗合解析プラン
※SurePrint G3 Human 8x60K v3 または SurePrint G3 Mouse 8x60K v2 での解析の場合のみご利用いただけます。
1枚のスライド(8アレイ)を複数のお客様でシェアするため、少数検体での実験・データ取得をお考えのお客様にお得なプランです。
納期は、乗合希望サンプルが規定数集まり次第の設定となります。
ご注文時点では納期未定となりますので、予めご了承ください。
乗合サンプルが集まらなかった場合は、品質検査通過後、最長でも3ヶ月以内に納品させていただきます。

 

スキャン・数値化

一連のサービスのご提供とともに、ハイブリダイゼーション済みのアジレントマイクロアレイをお預かりしてスキャン・数値化のみを行うサービスも承っております。
スキャン・数値化サービスの注文書はこちらからダウンロードできます。

 

納品データ

基本的な納品物は以下の通りです。

  • □作業報告書（書面、PDF形式）
  • □解析データ （Excel形式）
  • 　＊1比較に1ファイル作成いたします。
  • 　＊比較ごとにスキャッタープロットと発現変動遺伝子リストを確認することができます。
  • 　＊エクセルファイルなので特別なソフトがなくてもご利用 いただけます。
  • □スライドスキャン画像（TIFF形式、BMP形式）
  • □ Rawデータ（TXT形式）
  • □ RNA品質検査結果（PDF形式）
  • □ 作業プロトコル（PDF形式）
  • □ 解説資料（PDF形式）

データは CD-R またはDVD-R で納品いたします。
また、Windowsをご利用の場合のみ、データを暗号化することも可能です。

  • ※ 弊社のデータ保管期間は納品後6ヶ月です。
    納品後6ヶ月以上経過した解析についてのお問い合わせや追加解析を実施される場合、データを送付していただくことがございますので、データは大切に保管してください。

データマイニング ※オプション

オプションで各種データマイニングサービスもご用意しております。
詳しくはデータマイニングサービスページをご覧ください。
アレイ解析と併せてご注文のお客様には特別価格にてご提供いたします。

価格・納期

※単位：円 （税別）
サービス名 価格 納期※2
アジレント
遺伝子発現
アレイ解析※1		 1カラー
(乗合プラン)※3		 100,000-
/１解析		 下記条件に適応後、3週間（最大3ヶ月）
・サンプル品質検査合格
・乗合サンプル集積
2カラー
(乗合プラン)※3		 120,000-
/１解析
1カラー
（通常プラン）		 お問い合わせください 下記条件に適応後、3週間
・解析スライド入荷
・サンプル品質検査合格
2カラー
（通常プラン）		 お問い合わせください
スキャン・数値化 30,000-
/１スライド		 約1週間
スキャン・
数値化
オプション		 ノーマライズ 2,000-
/１アレイ		 約1週間
データ加工
(解析用データ作成)
※ノーマライズ料金を含む		 20,000-
/１比較
  • ※1 サンプル品質検査料金は2回分(再送分)まで価格に含まれております。
  • ※2 納期はご注文内容（解析数）によって変動いたします。
  • ※3 乗合プランは SurePrint G3 Human 8x60K v3 または SurePrint G3 Mouse 8x60K v2 での解析の場合のみご利用いただけます。

サービス内容、価格は予告なく変更されることがありますので、予めご了承ください。

注文方法

注文書に必要事項をご記入のうえ、下記宛先まで送付してください。
注文書受理後サンプルの送付方法等につきまして折り返しご連絡差し上げます。

注文書送付先
E-mail:array@hssnet.co.jp

サンプル送付先
〒001-0932
札幌市北区新川西2条1丁目2-1
北海道システム・サイエンス株式会社 解析チーム
マイクロアレイ解析サービス担当
TEL：(011)768-5903

サンプルについて

サンプルの種類 必要量 純度・状態
Total RNA※1 総量：500ng以上※2
濃度：50ng/μL以上
液量：10μL以上		 OD260/OD280：1.8～2.1※3
OD260/OD230：2.0以上※3
Nuclease Free水に溶解※4
RNA抽出からのご依頼はこちらをご覧ください。
  • ※1 弊社ではQIAGEN社 RNeasy Mini KitでのRNA抽出、および、RNase-Free DNase SetでのDNase処理を推奨しております。
  • ※2 アレイ解析に必要なサンプル量はスライドフォーマットによって異なります。
    フォーマットごとの解析最小量はこちらをご覧ください。
  • ※3 スピンカラムタイプの抽出方法、もしくは低濃度の場合、OD比は無視できる場合があります。
    詳しくはこちらをご覧ください。
  • ※4 DEPC水は反応を阻害する恐れがあります。RNAは必ずNuclease Free水に溶解してください。

サンプルの量・品質について

サンプルの品質チェック方法について、下記PDF に詳細をまとめておりますので、ぜひご参考ください。

サンプル送付方法

RNAサンプル（遺伝子発現アレイ解析サービス）
チューブが破損しないよう 50mL チューブやチューブBOX に入れ、印刷した注文書と、ドライアイスを5kg 程度同梱し、冷凍便 または 冷蔵便 にて送付してください。

スライドガラス（スキャン・数値化サービス）
スライドケースに入れ、アルミホイルなどで遮光の上、破損しないよう緩衝材等で保護し、印刷した注文書を同梱して 普通便(常温)で送付してください。

  • ※ サンプルやスライドガラスを送付していただく際は、①到着予定日、②輸送会社名、③追跡番号をE-mailにてお知らせください。
  • ※ 誠に勝手ながら、土・日・祝日の受け取りは行っておりませんので、平日着となるよう送付してください。
  • ※ 納品後のサンプルについては、RNAサンプルは3ヶ月、スライドガラスは1週間保管したのち、廃棄いたします。
  • ※ サンプルの返却をご希望の場合には、必ず注文書にご記入ください。
  • ※ データ納品時以外のサンプル返却は有償となりますので、予めご了承ください。

注意事項

  • ※ 製品の規格仕様・サービス内容などにつきまして、予告なしに変更することがあります。
  • ※ 受注後、実作業に入ってからのキャンセルはサービスの仕様上お受けいたしかねます。
    やむを得ない場合は実作業分の料金をご請求させていただきます。
  • ※ ご依頼いただくサンプルは、文部科学省の「遺伝子組換え生物等の使用等の規制による生物の多様性の確保に関する法律」（カルタヘナ法）におけるP1レベルのサンプルに限らせていただきます。
  • ※ 感染性のあるサンプル（HCV・HIVなど）の受け入れは弊社では行っておりません。
    また、ヒト臨床サンプルの場合はインフォームドコンセントを得ていることをご確認ください。
  • ※ 本受託解析サービスは、試験研究を目的にご利用ください。
    その他の目的（医療品・食品の製造・品質管理や医療診断など）には使用しないでください。
  • ※ 本受託解析サービスにより得られた結果が原因となり生じた損失・損害等について、サービスの仕様上、責任を負いかねます。
  • ※ ご提供・ご指示いただくサンプルや手法から生じる工業所有権・安全性などの問題については、一切責任を負いかねます。
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