分子量の計算方法

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弊社で算出する核酸オリゴの分子量は、塩基毎に下表のユニット分子量で計算しています。

※ RNA は各々 +16.00 です

分子量の計算は下式の通り、配列の塩基数(塩基種類毎)とユニット分子量の積算です。

DNAの場合：313.21×Aの塩基数 + 289.19×Cの塩基数 + 329.21×Gの塩基数 + 304.20×Tの塩基数 + 290.17×Uの塩基数 -62

RNAの場合：313.21×Aの塩基数 + 289.19×Cの塩基数 + 329.21×Gの塩基数 + 304.20×Tの塩基数 + 290.17×Uの塩基数 + 16×RNA塩基数 -62

※ 最終項の「-62」：出来上がりの核酸オリゴは3’と5’の両端が水酸基(下図)となりますが、ユニットの積算だけではすべての塩基に3’位リン酸化されている数値となってしまいます。そのため3’位リン酸基の余剰分を減算しています。

なお、特殊修飾オリゴに関しては、修飾官能基に応じた分⼦量を上式に加算して算出しています。

R＝H：DNA
R＝OH：RNA(O原子ひとつ分DNAより分子量が大きい)

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