アレイ標準解析データ例

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遺伝子発現マイクロアレイ・miRNAマイクロアレイサービスに標準でお付けしている解析データについてご紹介いたします。

シグナルテーブルは、各プローブのシグナル強度をまとめた表です。遺伝子やmiRNAごとの発現レベルを数値化し、解析に必要な基礎データを提供します。このデータは、後続の解析の基盤となります。
全遺伝子データと、ご指定頂いたサンプル比較ペアの発現変動遺伝子抽出データを作成します。

ボックスプロットは、各サンプルのシグナル強度の分布を視覚的に表現します。中央値、四分位範囲、最小値、最大値を示し、データのばらつきや異常値を一目で確認できます。サンプル毎のシグナル分布の違いを評価し、データの質を検証します。

スキャッタープロットは、2つのサンプル間のシグナル強度の関係を示す散布図です。遺伝子やmiRNAの発現パターンの相関関係を視覚的に確認できます。スキャッタープロットを用いることで、サンプル間の類似性や違いを簡単に見つけることができます。

相関解析は、各サンプル間のシグナル強度の相関を計算し、相関係数を提供します。これにより、サンプル同士の関連性を数値的に評価できます。高い相関係数はサンプル間の高い類似性を示し、低い相関係数は違いを示します。

主成分分析（PCA）は、多次元データを低次元に変換し、データの主要な変動要因を特定する手法です。PCAプロットは、サンプル間の全体的な関係性を視覚的に示し、群のパターン認識に役立ちます。

クラスター解析は、類似したサンプルや遺伝子をグループ化する手法です。これにより、遺伝子発現パターンやmiRNAプロファイルの共通性を発見しやすくなります。ヒートマップやデンドログラムを用いて、視覚的にクラスターの関係性を表示します。

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