光架橋性オリゴ CNV

• 製品の特徴
• 価格・納期
• 照射装置
• 参考文献

北海道システム・サイエンス株式会社は、日華化学株式会社より製造販売委託を受け、光架橋性オリゴCNVシリーズ製品の製造・販売を行っています。
従来、DNAの増幅・キャプチャーなどは長時間を要する温度操作にて行われていましたが、北陸先端科学技術大学院大学 藤本教授が発明したCNVシリーズ（CNV-K および CNV-D）をDNA に組み込むことで、光を用いて自由自在にDNA・RNAの二重鎖形成と解離を制御することができます。
この度、日華化学株式会社にて工業スケールでの安定供給・品質の確保を実現し、核酸試薬の供給が可能となりました。

 

製品の特徴

光架橋性オリゴとは？
UV照射 1秒で相補鎖のチミンと結合！
波長を変えることで簡単に乖離可能！

• 1秒で相補鎖のチミン （シトシンは25 秒） と共有結合
• 366nm のUV 照射でピリミジン塩基と100％架橋
• 312nm で可逆的に乖離可能
• DNA だけでなくRNA に対しても操作可能
• UV の波長と照射時間により架橋率をコントロール
• 光架橋のスイッチングのタイミングや場所を限定

光架橋性オリゴCNV 製品仕様
対応塩基数	11-50mer
合成スケール	0.2μmol、1μmol
精製方法	簡易カラム、HPLC
CNV シリーズ挿入	複数箇所挿入の場合は、ご相談ください。
各種修飾	5-Methyl-dC、2’-FluoroRNA 、Uracil(dU)、Inosineなど可能です。 ご相談ください。

 

【 用途① 】 FISH プローブのような遺伝子の検出に

【 遺伝子検出 （ FISH法 ） 】
CNV-K を用いた FISH 法による遺伝子の検出は、高次構造を形成している核酸に対しても有効です。
一般的なプローブでは高次構造を形成する核酸を検出することは困難です。CNV-K を含むプローブを用いることで、高次構造に入り込んで光架橋し、通常のプローブでは検出できない核酸の検出も可能です。

• ※ 参考論文： Bioorg. Med. Chem. Lett., 2016, 26, 5312-5314

[ 高次構造を持つ核酸のCNV-Kプローブを用いた検出 ]

 

【 用途② 】 siRNA 等のノックダウン実験に

【 細胞内での遺伝子発現制御 （ アンチセンス法 ） 】
細胞内において、CNV-K を含むプローブを用いたアンチセンス効果により、遺伝子発現を制御することができます。光照射により、細胞中に取り込まれたプローブが相補部分と架橋し、その遺伝子の翻訳をブロックします。UV 照射後、GFP-HeLa 細胞内で GFP 発現量が抑制されたことが、共焦点顕微鏡により確認されています。
参考 ： Biomaterials Science, 2014, 2, 9, 1154 -1157

[ アンチセンス法へのCNV-Kの適応 ]

 

価格・納期

DNAと同じデオキシリボースを基本骨格とする【 第一世代光クロスリンカー 】

※単位：円 （税別）

修飾名	合成スケール		納期
	0.2μmol	1μmol
光架橋性オリゴ CNVシリーズ [ CNV-K ]	15,000 / 箇所	25,000 /箇所	約10営業日※

※ 納期は、修飾内容により変更になります。

D-トレオニノールを基本骨格とすることで性能がアップ【 第二世代光クロスリンカー 】

※単位：円 （税別）

修飾名	合成スケール		納期
	0.2μmol	1μmol
光架橋性オリゴ CNVシリーズ [ CNV-D ]	20,500 / 箇所	34,500 /箇所	約10営業日※

※ 納期は、修飾内容により変更になります。

 

照射装置

光架橋オリゴCNVの架橋・乖離のためのUV照射に利用可能な機器を以下、ご紹介します。

※ 各製品の詳細・価格につきましては、販売元・製造元・代理店にお問合せください。

 

必要な照射装置スペック
【架橋】　366nm　光源(UVA)1800 mW/cm2×1秒＝ 1.8 J
【乖離】　312nm　光源(UVB)60 mW/cm2×2分＝7.2 J

参考文献

DNA Photo-cross-linking using 3-Cyanovinylcarbazole Modified Oligonucleotide with Threoninol Linker
Takashi Sakamoto; Yuya Tanaka; Kenzo Fujimoto*
Organic Letters, 2015, 17, 4, 936-939
Photo-regulation of constitutive gene expression in living cells by using ultrafast photo-cross-linking oligonucleotides
Takashi Sakamoto; Atsuo Shigeno; Yuichi Ohtaki; Kenzo Fujimoto*
Biomaterials Science, 2014, 2, 9, 1154-1157
The Site-Specific Cytosine to the Uracil Transition Using Reversible DNA Photocrosslinking
Kenzo Fujimoto; Takashi Sakamoto; Kaoru Konishi-Hiratsuka; Yoshinaga Yoshimura
ChemBioChem, 2010, 11, 1661-1664
A new approach for reversible RNA photocrosslinking reaction: application to sequence-specific RNA selection
Yoshinaga Yoshimura; Tomoko Ohtake; Hajime Okada; Kenzo Fujimoto
ChemBioChem, 2009, 10, 1473-1476
Ultrafast Reversible Photocrosslinking Reaction: Toward in Situ DNA Manipulation
Yoshinaga Yoshimura; Kenzo Fujimoto
Org. Lett., 2008, 10(15), 3227-3230

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