リピートモチーフ検索

次世代シーケンスデータを使用して、ゲノム上のリピートモチーフ(※マイクロサテライト、SSR、STR)を検索します。ゲノムサイズの大きな動植物でも、少量のリードデータからリピートモチーフを検索することができます。

※ リピートモチーフについて
リピートモチーフは、ゲノム上に存在する数塩基の繰り返し配列で、多型解析のマーカーとして使用されます。マイクロサテライト(microsatellite)、SSR(simple sequence repeats)、STR(short tandem repeat)とも呼ばれます。

HSS:リピートモチーフ検索

 

解析例

ご用意いただくサンプル

精製済みゲノムDNA

  • サンプル必要量ページ の「Illumina DNA-Seq」内、「対応アプリケーション:DNA-Seq」の項目をご参照ください。

弊社作業内容

  • ・DNAライブラリ調製
  • ・MiSeq 300bp ペアエンドシーケンス 10万リードペア(60Mb)/ 検体
  • ・リピートモチーフ検索

価格

201,000円 / 検体(税別)

 

納品データ

リピートモチーフとその前後の塩基配列情報をまとめたテーブルを納品いたします。
リピートモチーフを挟む領域でPCRプライマーを設計していただくことができます。

HSS:リピートモチーフ検索

サービス一覧へ戻る
Page Top