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リピートモチーフ検索
次世代シーケンスデータを使用して、ゲノム上のリピートモチーフ(※マイクロサテライト、SSR、STR)を検索します。ゲノムサイズの大きな動植物でも、少量のリードデータからリピートモチーフを検索することができます。
※ リピートモチーフについて
リピートモチーフは、ゲノム上に存在する数塩基の繰り返し配列で、多型解析のマーカーとして使用されます。マイクロサテライト(microsatellite)、SSR(simple sequence repeats)、STR(short tandem repeat)とも呼ばれます。
解析例
ご用意いただくサンプル
精製済みゲノムDNA
- ※ サンプル必要量ページ の「Illumina DNA-Seq」内、「対応アプリケーション:DNA-Seq」の項目をご参照ください。
弊社作業内容
- ・DNAライブラリ調製
- ・MiSeq 300bp ペアエンドシーケンス 10万リードペア(60Mb)/ 検体
- ・リピートモチーフ検索
価格
201,000円 / 検体(税別)
納品データ
リピートモチーフとその前後の塩基配列情報をまとめたテーブルを納品いたします。
リピートモチーフを挟む領域でPCRプライマーを設計していただくことができます。