北海道システム・サイエンス
HSSお勧めサービスのご案内



★ Sequel System 受託サービス開始 ★

超ロングリード次世代シーケンサー
Pacific Biosciences社 Sequel System 登場!


より高いスループットを実現!
PacBio RS U の7倍のデータ出力!
真核生物のDe novo シーケンスの解析がよりリーズナブルに!

PacBio RSU Sequel System
原理 Single Molecule Real Time sequencing
平均リード長 約 10kb
1セルあたりの
反応ウェル数
15万ウェル 100万ウェル

【 お問い合わせ・お申込先 】  解析部 シーケンスチーム
TEL   : 0120-613-190 or 011-768-5903
E-mail :
詳細は こちら



★ 超ロングリード第3世代シーケンス解析 PacBio ★

「 PacBio RSU 」は、DNA合成を1分子単位でリアルタイムに検出する 「 SMRT ® DNAシーケンス技術 」 を
用いたロングリードシーケンサで、圧倒的なロングリードと、 99.999%のコンセンサス精度を実現します。
完全長ゲノム配列決定、 繰り返し配列のシーケンス、 完全長cDNAのシーケンス 等に最適です。


圧倒的なロングリード! P6C4試薬を使用! 40kb以上の最大リード長、10kb以上の平均リード長
99.999%のコンセンサス精度! PCR増幅時のエラー ( GCバイアス ) の影響を受けません


◎ 必要サンプル量 : 20μg以上
◎ 納期 : 〜8週間
◎ 納品データ : シーケンス結果レポートファイル
リード配列データ ( FASTQ形式 )
◎ 1 SMRT Cellあたりの参考取得データ量 : 300MB〜
取得データ量はカタログスペック最大値で保証値ではございません。
詳細はお問い合わせください。

【 お問い合わせ・お申込み先 】  解析部 シーケンスチーム
TEL   : 0120-613-190 or 011-768-5903
E-mail :
詳細は こちら



★ 認定宿主ベクター系 ロドコッカス属細菌 タンパク質発現システム ★

低温条件下でタンパク質発現が可能なため、中温条件下で「宿主細胞にとって致死性があるタンパク質」、 「宿主細胞の増殖を阻害するタンパク質」、「封入体を形成し凝集するタンパク質」などの組換えタンパク質を 発現・精製できることが期待できます。
Rhodococcus erythropolis L88 Competent Cells と pTip, pNit, pCpi Vector シリーズの組合せにて実現可能。
※ 本製品は国立研究開発法人産業技術総合研究所よりライセンスを受け、HSSにて製造、販売しています。

【 お問い合わせ・お申込み先 】
  購買部・購買チーム
TEL 0120-613-190 or 011-768-5903
E-mail goods@hssnet.co.jp
 
サービスの詳細はこちら
ロドコッカス属細菌 タンパク質発現システム ホームページは こちら



★ HSSのmRNA発現解析 〜 最適な解析プランのご提案 〜 ★

■ マイクロアレイ or 次世代シーケンス どちらを利用するか、お悩みの場合はこちら!

ゲノム情報の有無やご用意いただく検体数などに応じて、適切なプランをご提案いたします。
マイクロアレイと次世代シーケンス、どちらを利用した方がいいのか判断に迷う場合は、下記の Yes/No チャートをお試しください!



■ お問い合わせ先
TEL 0120-613-190 or 011-768-5903
E-mail 解析部 マイクロアレイチーム

解析部 シーケンスチーム
1.カタログアレイプラン
Agilent社のマイクロアレイを使用し既知遺伝子の網羅的な発現比較解析を実施します。低コストかつ納期が早いため、お急ぎの場合にお勧めです。

2.カスタムアレイプラン
公共データベース若しくはお手持ちのTranscript情報からカスタムアレイを作成し発現比較解析を行います。アレイ解析ならNGSよりも低コストで比較解析を実施することが可能!多検体の場合にお勧めです。

3.NGS+カスタムアレイプラン
NGS解析にて構築した推定Transcript配列からカスタムアレイをデザインし、発現解析を行います。アレイ解析ならNGSよりも低コストで比較解析を実施することが可能!多検体(レプリケート)の場合にお勧めです。

4.NGS mRNA 解析プラン
NGS RNA-Seqで読まれたリードを参照ゲノム配列にマッピングし、各遺伝子領域にマッピングされたリードの本数に基づき発現プロファイルを決定します。取得リード数を増やすことで、アレイでは検出できない低発現Transcriptの解析が可能です。

5.NGS 新規転写産物解析プラン
NGS RNA-Seqにてシーケンスデータを取得し、マッピング結果からゲノム上の転写領域を推定することで、データベースに登録されていない新規転写物領域候補を探索します。アレイではできない新規転写産物の発現変動解析が可能です。

6.NGS de novo トランスクリプトーム解析プラン
非モデル生物等ゲノム情報がない場合には、NGS RNA-Seqにて取得したリードをアセンブルしてゲノムの代わりとなる推定Transcript配列を取得します。各検体の取得リードを推定Transcript配列に対しマッピングすることで発現比較解析が可能です。

   ※ 各プランは真核生物を対象として設定しております。
      原核生物の場合はお問い合わせください。


Next STEP
発現解析の後は、メタボローム解析!!
詳しくはこちら



★ 次世代シーケンス解析 おまかせプラン ★

ゲノムDNA または Total RNA をご提供いただくだけで、解析までトータルサポート!

■ De novo ゲノム解析プラン (例 : ゲノムサイズ〜5Mb程度の細菌)



■ 他にも解析プランをご用意しております。サービスの詳細は、 までお問い合わせください。 詳しくは こちら



★ De novo トランスクリプト−ム発現解析サービス ★

『データベースがない』と諦めないで!! 〜RNA-Seq×カスタムアレイ〜

  ゲノム配列情報のない生物種
生物種、解析目的に応じたアプリケーションをご提案いたします。
お気軽にお問い合わせください!

■ 問い合わせ先E-mail

   ・次世代シーケンス解析サービス

 ・アジレントマイクロアレイ解析サービス






北海道システム・サイエンス株式会社