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FAQ-シーケンス

シーケンスに関する質問

Q : 注文の仕方が分からないのですが・・・
Q : シーケンスサンプルの送付方法は?
Q : 納期はいつ頃になりますか?
Q : Eメールで依頼書を送ったのですがこの日が受注日ですか?
Q : 追加解析したいのですが・・・
Q : 電気泳動写真は必要なのですか?
Q : シングルエクステンションとは何ですか?
Q : プライマーウォーキングって?
Q : Single Strand Sequencing(SSS法)って?
Q : Double Strand Sequencing(DSS法)って?
Q : 精製していないサンプルを送ってもいい?
Q : どの程度の量を送付したらいいですか?
Q : サンプル・プライマーは保管してくれるの?


質問に対する答え
Q : 注文の仕方が分からないのですが・・・
A .
 まず、ご依頼書にてお申し込みください。
ご依頼書はこちらよりダウンロードしていただき、必要項目にご記入の上、添付ファイルとしてEメールをseq@hssnet.co.jpまで送付ください。依頼書送付後にサンプル、プライマーを送付ください。
Q : シーケンスサンプルの送付方法は?
A .
 郵送、宅配便どちらもクール便での送付をお勧めしております。
サンプルは1.5mLチューブに入れ送付下さい。また損失・破損を防ぐため、チューブのフタにパラフィルム等でふたをして、コニカルチューブなどの頑丈な物に入れご送付くださいますようお願いいたします。
破損しやすい0.2mLのご使用はご遠慮ください。
サンプル送付に併せて電気泳動写真の添付をお願いいたします。
Q : 納期はいつ頃になりますか?
A .
 サンプル到着日を受注確認のため0日目とさせていただき、土日祝日を除いた営業日で換算して2日以内=2営業日以内に結果をご報告させていただいております。

 ☆サンプル到着後にEメールにて納期のご連絡を差し上げております。
 ☆サンプル送付後1週間経っても連絡がない場合は、お手数ですがご連絡ください。
Q : Eメールで依頼書を送ったのですがこの日が受注日ですか?
A .
 いいえ、弊社では依頼書を送付いただいた日を依頼日、弊社にサンプルが到着した日を受注日とさせていただいております。
受注日(サンプル到着後)にEメールにて納期のご連絡を差し上げております。
また、サンプルが到着しても依頼書が送付されていない場合や、依頼書の記入漏れなどがあった場合にはご本人様に依頼内容の確認がとれるまで、解析を保留とさせていただく場合がございます。
Q : 追加解析したいのですが・・・
A .
 解析終了後3日以内にお手数ですが、サンプル送付日と追加解析希望との旨を 明記の上、再度ご依頼書にてお申し込み下さい。
同じサンプルで2回以上の追加解析をご希望される場合は、サンプルの残量についてお問い合わせいただけると幸いです。
Q : 電気泳動写真は必要なのですか?
A .
 必ず添付をお願いします。ご依頼書に記入いただいたサンプル濃度と添付いただいた電気泳動写真をもとに、サンプルの使用量を決定しております。(RNAやプライマーの残存などのサンプル状態や濃度確認も行っております。)
また、写真には以下の記入をお願いします。

・ サンプルアプライ量(uL)
・ マーカーの情報(ngやuLなど)

☆電気泳動写真を添付いただくことは、迅速な解析結果のご報告や解析結果の検討ができることにつながります
Q : シングルエクステンションとは何ですか?
A .
 1Sample、1Primerを使用しての1シーケンス反応(1run)のことで、解読した結果(読み切り形式)をご報告しております。サンプルの状態により異なりますが、解析塩基数は平均400〜500塩基です。料金は1反応あたり3500円となっております。

・詳細はこちら
Q : プライマーウォーキングって?
A .
 配列未知のDNAが数kb以上ある場合は、まずシングルエクステンションを行い、その結果を元に次のプライマーを設計し、さらにシーケンスを進めていく必要があります。このような「シーケンス→その結果を見てプライマーを設計する→またシーケンス…」というように、そのつど得られたデータをつなげていくのがプライマーウォーキングです。
 
 弊社ではプライマー設計・合成、また、解析と解析結果のアセンブルまでを含めた解析プランをご用意しております。目的に応じてSingle Strand Sequencing、Double Strand Sequencingから選択いただけます。

・詳細はこちら
・価格はこちら
Q : Single Strand Sequencing(SSS法)って?
A .
 鋳型DNAの片鎖だけをシーケンスする方法です。解析結果はHomology searchにお使いいただけます。

・詳細はこちら
Q : Double Strand Sequencing(DSS法)って?
A .
 鋳型DNAの両鎖をシーケンスする方法です。確実に塩基配列を決定することができるため、結果をそのままPublicationにお使いいただけます。

・詳細はこちら
Q : 精製していないサンプルを送ってもいい?
A .
 サンプルは弊社で扱っておりますLabo pass™等のキットによる精製をお勧めしております。PCR産物の切り出し精製などに関しては各種オプション(別途料金)にてお受けしております。
Q : どの程度の量を送付したらいいですか?
A .
 解析数=反応数により異なります。
1サンプル×1プライマーでの反応=1解析あたりの送付量を以下の表にまとめてありますのでご確認をお願いします。

■プラスミドサンプルの場合
(1解析あたりの送付量となっておりますのでご注意ください)
サンプルサイズ
サンプルの必要濃度
サンプル送付量
2〜4kbp
0.2ug/uL=200ng/uL
10uL以上
6kbp
0.3ug/uL=300ng/uL
10uL以上
8kbp
0.4ug/uL=400ng/uL
10uL以上
10kbp
0.5ug/uL=500ng/uL
10uL以上

■PCR産物の場合
(1解析あたりの送付量となっておりますのでご注意ください)
サンプルサイズ
サンプルの必要濃度
サンプル送付量
100〜500bp
10ng/uL
10uL以上
500〜1000bp
10〜20ng/uL
10uL以上
1000〜2000bp
20〜40ng/uL
10uL以上
>2000bp
40〜100ng/uL
10uL以上

■プライマー
 プライマーは1解析あたり10uM程度で10uL以上の送付をお願いします。
Q : サンプル・プライマーは保管してくれるの?
A .
 シーケンス解析で使用したサンプルとプライマーの保管・返送は原則的に行っておりません。そのため、弊社の都合により申し訳ございませんが、原則として「シーケンス解析終了後、3日間保管の後に破棄」 させていただきますので予めご了承下さい。
 
 ※弊社で合成を行ったシーケンスプライマーは全て返送させていただきます。
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