北海道システム・サイエンス
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製品・サービス情報
微生物同定
製品仕様 価格・納期 注文方法 注意事項
 
微生物同定サービスでは、Applied Biosystemsの「MicroSeq® Kit」を用いて、バクテリアサンプルの
16S rRNA遺伝子上流部(約500bp)の塩基配列に基づく、バクテリアの簡易同定を行います。

※ 16S rDNA全長解析、および、真菌類(カビ、酵母)につきましては、別途お問い合わせください。

■製品仕様
製品仕様
ご提供いただくバクテリアサンプルよりDNAを抽出後、16S rDNA Top500領域をPCRにより増幅します。得られたPCR産物はダイレクトシーケンスにより塩基配列を決定後、データベース上でBLAST検索を
実施することにより、既知の微生物の16S rDNA配列との相同性検索を行い、近縁種と推定される
微生物リストを作成いたします。
■作業内容■
・バクテリアからのDNA抽出
・16S rDNA Top 500bp領域のPCR増幅
・シーケンス解析 (両鎖)
・塩基配列データベース上でのBLAST検索
・同定結果報告
試 薬: DNA抽出 PrepMan™ Ultra Sample Preparation Reagent
  PCR増幅 MicroSeq® 500 16S rDNA PCR Kit
  シーケンス MicroSeq® 500 16S rDNA Sequencing Kit

機 器: PRISM 3100 Genetic Analyzer
 
納 品
解析結果は E-mail にてご報告いたします。
  納品データ
    ・作業報告書 (同定結果)  (PDF形式)
    ・シーケンスデータ 塩基配列データ(TXT形式)
    波形データ(PDF形式)
    コンティグデータ(TXT形式)
  ※ Raw Data(ABT形式)をご希望される場合は、ご相談ください。
※ データ数が多い場合、事前に納品方法に関して、ご相談させていただく場合がございます。
■価格・納期
価格・納期
  ※単位:円 (税別)
 
サービス内容 価格 納 期
微生物同定 42,000 / 1検体 2週間〜
  ※ 検体数・解析状況等によりましては、納期を多くいただく場合がございます。
    注文本数が多い場合には、別途お問い合わせください。
■注文方法
注文方法
  注文書をダウンロードしていただき、必要項目にご記入の上、添付ファイルとしてE-mailを まで送信して
ください。

注文書送信後、必要項目をご確認の上、注文書を併せて、
下記まで送付してください。
なお、送付いただく際は、「シーケンスサンプル在中」と明記してくださいますよう、お願いいたします。

〒001-0932 札幌市北区新川西2条1丁目2-1
北海道システム・サイエンス株式会社
ライフサイエンス本部 解析部 シーケンスチーム
 
※ 土・日・祝日はサンプルの受け取りを行っておりませんので、平日着となるよう送付してください。
※ サンプル送料は、実費お客さまのご負担となります。
解析に必要なもの
サンプル 培養検体・・・スラント、シャーレ、その他。※1
抽出済みDNA・・・PCR可能な精製レベルのもの。※2
電気泳動写真 同じゲル上にマーカーおよびサンプルを泳動し、泳動量を記したもの
注文書 弊社ホームページ上よりダウンロードしてください。
  ※1 弊社では試料の単離作業は行っておりません。必ず純粋培養された菌株を送付してください。
※2 病原性を有する、もしくは病原性を有する可能性のある微生物の受け入れは行っておりません。
   サンプルは抽出済みDNAの状態まで調製してください。
  ※3 送付いただいたサンプルは、解析終了後、滅菌破棄いたします。
     サンプルの返却をご希望の場合は、必ず事前にご連絡ください。
■注意事項
注意事項
  ・本サービスは、バクテリアを対象としたKitを使用しているため、真菌類(酵母・カビ)を試料とした同定に
 は対応しておりません。真菌類(酵母・カビ)の同定をご希望の場合は別途お問い合わせください。
・バクテリアの種類によりましては、本サービスで使用しているKit が適合しない場合もございます。
 この場合、同定を行うことが困難となります。
 また、上記理由により、弊社にて作業が進行不可能と判断された場合は、実費分として\7,000/1検体
 をご請求させていただき、解析を終了いたしますので、予めご了承ください。
・送付いただいた試料の単離が不十分なために、シーケンス解析において塩基配列の特定が困難と
 なってしまう場合は、全額ご請求となりますので、予めご了承ください。
・ご依頼いただくサンプルは、文部科学省が「遺伝子組換え生物等の使用等の規制による生物の
 多様性の確保に関する法律」(カルタヘナ法)におけるP1レベルのサンプルに限らせていただきます。
・病原性を有する、もしくは病原性を有する可能性のある微生物の受け入れは行っておりません。
 サンプルは抽出済みDNAの状態まで調製してください。
・ヒト臨床サンプルの場合はインフォームドコンセントを得ていることをご確認ください。
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