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FAQ
【重要】サンプル発送先変更のご案内

弊社ではこの度、受託DNAシーケンス(キャピラリーシーケンス)サービス
につきまして解析サンプルの発送先を変更することとなりました。

今回の変更に伴い、
7月2日(月)到着分より、受託DNAシーケンス(キャピラリーシーケンス)サービスの
解析サンプルを弊社【 羽田核酸製作所 】 あてに発送していただけますようお願いいたします。
■ 詳細はこちら

今までご利用をいただきましたお客様には、大変ご迷惑をおかけすることになりますが、
何卒、ご理解を賜りたくお願い申し上げます。

7月2日以降のサンプル送付先
〒144-0041
東京都大田区羽田空港1-6-2 第四綜合ビル
北海道システム・サイエンス株式会社
羽田核酸製作所 シーケンスチーム宛
TEL:03-6840-1005

※ 土・日・祝日はサンプルの受け取りを行っておりませんので、平日着となるよう送付してください。


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Primer Walking
Primer Walkingサービスでは、DNAサンプルをご提供いただき、プライマーウォーキング法による 長鎖塩基配列を決定いたします。
解読した塩基配列から、随時、弊社にて迅速にプライマー設計・合成、シーケンス解析を行い、 質の高いデータの提供を行っております。
サービス内容 納品 価格・納期 解析に必要なもの  
■Primer Walking
サービス内容
送付いただいたDNAサンプルを用いて、複数回のシーケンス解析を実施いたします。
解読した塩基配列からプライマー設計・合成、シーケンス反応という作業を繰り返し、
長鎖のシーケンス解析を実施いたします。
片鎖解析 (SSS法)、両鎖解析(DSS法)のいずれかを、目的に応じてご選択いただけます。
  ■作業内容■

・ 品質検査
・ プライマー設計・合成
・ シーケンス反応
・ シーケンサーRUN
・ データ確認
・ アセンブルデータ作成
  試薬: BigDye Terminator v3.1
  機器: 3730xl DNA Analyzer
3130xl Genetic Analyzer
  SSS法



   
DSS法
  1回のシーケンス反応で解読できる平均鎖長は約500塩基です。ご希望の解析塩基数に応じて、必要数の解析を繰り返し実施いたします。
例)約3.0kbのPrimer Walking(SSS)をご希望の場合、通常、約6回
  (3,000bp÷500bp/回=6回)のシーケンス反応を実施いたします。
納品
  解析結果はウェブサイト経由および CD-R にて納品いたします。

納品物 CD-R収録データ
・弊社合成プライマー
・CD-R
・塩基配列データ(txt形式)
・波形データ(Ab1形式)
・アセンブルデータ(txt形式)
・プライマー情報

初回の方にはAb1データの見方(専用ソフトダウンロードのご案内)を記載したファイルも一緒に送付いたします。
ご希望に応じて、解析の進行に合わせて1シーケンス反応で得られた結果を
E-mailにて随時ご報告しております。
ウェブサイトにアップロードしたデータは3か月ほどで消去されますのでご注意ください。
価格・納期
  ご希望の解析塩基数に応じて、必要解析数が異なるため、価格・納期が変動いたします。
Primer Walking 解析に必要なプライマー設計、合成、シーケンス解析、および アセンブルまでを含めた金額です。
 
※単位:円 (税別)
希望解析塩基数 片鎖(SSS) 納期 両鎖(DSS) 納期
1.0kbp以下 22,000 約2週間 44,000 約2週間
1.5kbp以下 30,500 約3週間 61,000 約3週間
2.0kbp以下 39,000 78,000
2.5kbp以下 56,000 約1ヶ月 112,000 約1ヶ月半
3.0kbp以下 64,500 129,000
3.5kbp以下 73,000 146,000
4.0kbp以下 81,500 163,000
5.0kbp以下 107,000 約1ヶ月半
〜2ヶ月
214,000 約2ヶ月
〜2ヶ月半
6.0kbp以下 124,000 248,000
7.0kbp以下 149,500 299,000
8.0kbp以下 166,500 333,000
9.0kbp以下 192,000 384,000
10.0kbp以下 234,500 469,000
 
納期は、サンプル数や解析状況等により変更となる場合がございます。
目安としてお考えください。
解析対象が既知配列の場合は、納期の短縮が可能です。ご相談ください。
解析に必要なもの
 
DNAサンプル プラスミド・・・濃度100〜300ng/μL、必要量※1
PCR産物・・・濃度10ng/μL以上、必要量※1,2
プライマー
(カスタムプライマー)
サンプルの種類に関わらず 濃度10μM、10μL以上
プライマーは初回解析に使用いたします。
(無償のユニバーサルプライマーを使用する場合は、こちらから
ご指定ください)
電気泳動写真 同じゲル上にマーカーおよびサンプルを泳動し、泳動量を記したもの
注文書 弊社ホームページ上よりダウンロードしてください。
  ※1 DNAサンプルの送付量は、ご希望の解析塩基数により異なります。
サンプルは1回の反応で1〜5μL使用いたします。
1回の反応で約500塩基解読できるものと仮定し、できる限り多目にご提供ください。
※2 PCR産物は、PCR反応後に精製を行うことをお勧めいたします。弊社でのサンプル精製をご希望の場合は、こちらでご確認ください。
※3 電気泳動写真はなるべく送付いただけますようお願いいたします。
※4 受託シーケンスサービス注文書の解析プランでPrimer Walking(SSS)か(DSS)をご選択ください。

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